危氏点灯，黎元洪穿衣下床走到外屋。蔡汉卿报告道：“报告都督，城内出了乱子，黄申芗自命为总司令，带八协士兵‘倒孙’，要打倒孙武，已把大朝街包围。”黎元洪道：“黄申芗怎么带兵闹事？ 为什么打倒孙武？”蔡汉卿道：“原因不详。”黎元洪魂魄稍定，喘口气道：“太胡闹，我回军政府，外面情况怎样？”蔡汉卿道：“外面满街乱兵，夜深行动不便，还是待天亮后，部下带兵保护都督 去军政府。”
黎元洪又问：“军政府情况若何？”蔡汉卿道：“已派兵保护。”黎元洪夸奖道：“汉卿真胆识过人，明日我要委你重任。”蔡汉卿说道：
“多谢都督栽培。”
拂晓，乱兵回营。黎元洪在重兵护卫下入军政府，各方立即送来报告：黄申芗率部“倒孙”，在孙武公馆设总司令部；第四镇统制邓玉麟被赶走；第二镇统制张廷辅被枪杀；城内居民遭抢劫。黎元洪大 为震惊，命令蔡汉卿关闭城门，缉拿凶手，负责城防。派参谋通知黄申芗前来报告事变经过。
黄申芗进军政府就被卫队夺下指挥刀和手枪，押入议事厅，军务部人员先已到齐。黎元洪走出质问黄申芗道：“你协昨夜干的什么事？”黄申芗答道：“共进会同志昨夜去孙武公馆找他讲理。孙武潜逃 ，触怒众人。起义前，孙武一贫如洗，今日挟资致富。部下已将其财产登记在册，请都督过目。”说着，呈上明细表册。
黎元洪也不看表册，厉声说道：“第二镇统制张廷辅被枪杀，凶手是谁？居民遭抢劫，这又是为什么？”黄申芗道：“我是在尽量维持秩序……”黎元洪道：“你带兵闹事，你是怎样维持秩序的？那请 你来做都督好了。”黄申芗嗫嚅说道：“孙武太对不起人。”黎元洪道：
“孙武如何，从未听到你们有过报告。他纵有不是，能够这样自由行动吗？”黄申芗改口道：“请都督维持秩序。”黎元洪申斥道：“你破坏了秩序，叫我来维持吗？”周围军务部人员都对黄申芗怒目 而视。黄申芗自知事态严重，连声道：“请都督做主，请都督做主。”黎元洪道：“你要打倒军务部，你就来当军务部长，军务部人员都在这里。
或者你担任第四镇统制，负责武昌城防，首先把昨晚杀人、抢劫的凶犯捉来。”黄申芗道：“不敢当，不敢当。”黎元洪道：“既然你不敢承当，只有暂时回避了。”黄申芗低头谢罪，无言回答。黎元 洪命黄申芗退下，宣布第七协统领蔡汉卿升任第四镇统制，全面负责武昌城防治安。
与此同时，孙武在汉口闻知武昌发生骚乱，公馆被抄，怒不可遏，但又不敢渡江回武昌，便向报界发表宣言称：“……闲散军士集合暴动，行同匪类，将武家抄洗一空……今后入山，谢绝世事……”
另有，与孙武友好而去职者有邓玉麟、高尚志、潘善伯、牟鸿勋等数十名原共进会干部。从此，共进会便无形解体了。
蒋翊武在汉口日租界设立招抚机关，忽传武昌变乱，第二镇统制张廷辅遇害，不禁失声恸哭。张廷辅原是文学社经理部长，起义前以小朝街十号为总机关。事泄后，张廷辅全家被捕入狱。首义功臣竟遭 暗害。蒋翊武痛心疾首，也发表公电痛斥暴行，宣布将以武装维持治安云云。
各国驻汉口领事馆及京、沪各大报社，更把武昌“倒孙”大加渲染，披露报端。南京政府致电黎元洪查询一切。黎元洪则不愿家丑外扬，更不愿事态扩大影响个人声誉，复电称：“顷据军界同人呈称， 军务部长孙武，不克称职，请予撤换……现已遵照临时政府电谕，改部为司，委任曾广大为军务司长……外间传言军民暴动，孙武家属被戕，悉无其事……”
武昌“倒孙”骚乱之时，北京城亦正酝酿一场更大的“兵变”。
袁世凯无意南下就职第二任临时大总统，南京参议院便派出蔡元培、宋教仁、汪精卫等五人为专使前往北京“催驾”。蔡元培一行抵京，只见车站搭起彩门，悬挂五色国旗，一片节日气氛。袁世凯特开 正阳门以示隆重欢迎。当日下午，袁世凯便会见南下专使，蔡元培呈递孙文请袁南下就职的手书及参议院选举袁为临时总统的选举状。次日，袁世凯又邀请五专使举行茶话会，热情周旋，连声说道：“ 正准备南下，正准备南下；安排留守人员，即可就道。我不但要到南京，还须去武昌，与黎副总统晤面。”于是，袁世凯命把地图拿来摊开，指点说道：“先沿京汉铁路南下到汉口转武昌，然后再乘轮 船至南京。届时请诸位先生同行可以吗？”专使们连连点头微笑，心想袁世凯不好再推辞了。
蔡元培等五专使在迎宾馆下榻，北京、天津各团体代表纷纷前来拜访。或座谈、或请愿、或上书，众口一词都说袁世凯不可离开北京。蔡元培等便婉言解释。来访者络绎不绝，军事将领也拍来电报，专 使们穷于应付，疲惫不堪。
到正月十二日晚间七时半，忽然驻扎朝阳门外东狱庙的第三镇第九标炮营一声枪响，士兵们呼啸拥上街头，个个歪戴军帽，手持铁器棍棒，抢街掠巷，然后冲进朝阳门内。接着，禄米仓、帅府园、煤渣 胡同及东城土地庙驻军群起响应。散兵满街，呼啸过市。
一时枪声大作，火焰腾空，变兵沿途骚扰，土匪、流氓趁火打劫。凡金店、钱庄、首饰楼、钟表铺、饭馆、广货店等均遭抢劫。商民百姓哭天不应，哭地不灵。
南京政府五专使下榻迎宾馆，地处煤渣胡同。兵变之时，正在餐厅准备用饭。饭菜已经摆好，刚要入座，忽闻远处枪响，接着胡同内一片嘈杂声，乱枪猝发，附近燃起大火。专使们大骇，忙问：
“外面发生什么事？”侍者前来报告道：“驻军闹兵变了，反对袁宫保离开北京。”侍者又来商量说：“乱兵闹事不得了，躲避一下吧！隔壁是教堂，有洋兵保护，乱兵不敢进去，不如把饭菜搬到那边 去吃。”五专使胆战心惊，只好答应去教堂用餐。忽然，侍者又跑进来说：“乱兵进街了，外面不能走，赶快搬梯子翻墙头去教堂。”果然门口已被乱兵围住，一片吵闹声，乱兵在喊：“我们找南京专 使说理。”专使急随侍者翻墙，蔡元培、汪精卫还未走脱，乱兵已持枪冲进宾馆。蔡、汪转身躲进一间小屋，把门闩紧。乱兵闯进饭厅，乱喊乱叫，寻找南京专使，人未找到，便把饭桌掀翻，呼啸而去 。
乱兵骚扰经宵，商民遭抢劫的有数千家。天亮后，袁世凯派副大臣梁士诒到宾馆看望五专使。见面寒暄，梁士诒叹道：“现在全国倡行革命，人心浮动，北方秩序很难维持，像目前这种情形，如果不能 及时调度、弹压，确保地方安定，就很容易引起外国对我国用兵的祸事，这一点是切实应该注意的。”专使们既受兵变惊吓，又看到马路上洋兵进城保护使馆，早已心慌意乱，不知如何是好。梁士诒道 ：“此地也不安全，诸位还是搬到六国饭店下榻吧！”
至此，南京五专使只有听人摆布。住进六国饭店后开会磋商，致电南京政府，提议取消对袁世凯南下要求，准许袁世凯在北京宣誓就职。
袁世凯则发表通电，述说北京兵变，不能南下之苦衷，建议由副总统黎元洪到南京代受职权。武昌黎元洪复电：“不能前往。”同时，黎元洪也通电全国说：“舍南京不至乱，舍北京必至亡。”北京段 祺瑞、姜桂题、冯国璋三军统亦发通电：“临时政府必应设于北京。”湖南都督谭延闿亦通电：“……非建都北京，不足以谋五族之统一……”
保定、天津亦相继发生兵变，抢劫，焚毁，与北京如出一辙。
北京兵变产生预期效果。3月6日，南京参议院议决六条，允许袁世凯在北京就职。
3月10日，袁世凯身着大礼服，在北京宣誓就职中华民国第二任临时大总统。蔡元培等专使出席仪式。时间仅只半年多，袁世凯由高卧彰德赋闲之废员而东山再起，由湖广总督、钦差大臣，直至内阁总理 大臣。最后，取得中华民国临时大总统宝座。
4月1日，孙文以大总统名义公布参议院法后，至参议院行解任礼，将印绶交还参议院并发布解职令。袁世凯立即致电孙文：“……公为民国第一华盛顿，功成自退，万众倾心……乞即日北上，惠我方针 。”
孙文阅电报后鄙夷一笑，自语道：“何来功成自退？真伪善之极。”正这时，胡汉民持电报前来说道：“武昌黎副总统及湖北公电，邀请先生赴鄂巡视。”
