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第116章 服务于结构生物学领域

记博亚捷晶科技(北京)有限公司总经理孙辛博士

孙辛,男,1962年11月出生于北京,1987年毕业于北京大学医学部药学院,毕业后进入中国科学院生物物理研究所工作。1992年起就读于瑞典卡罗林斯卡学院的诺贝尔医学研究所,并于1998年底获得分子遗传学博士学位。1999年,作为博士后加盟美国辉瑞密西根药物研发中心,参与广谱金属蛋白酶抑制剂分子机制的研究工作。2003年3月回国,在天津金世药业短期供职。2006年初与合作者在中关村科技园区共同创立了博亚捷晶科技(北京)有限公司(XtalQuest Inc,),从事蛋白质制备、蛋白晶体生长及蛋白质晶体结构解析等方面所用的仪器、耗材与试剂的研发。现任北京博亚捷晶科技有限公司总经理。

自主研发高新科技产品,已经成为中关村科技园创业人员的共同目标。北京博亚捷晶科技有限公司自主研发蛋白质结构与功能研究所需的仪器及耗材,正在为从事相关领域的科研机构及生物技术相关企业带来快捷和效益,北京博亚捷晶科技有限公司是整个亚洲地区唯一专门从事蛋白结晶及相关领域仪器及耗材服务的公司。

采访那天,孙博士正好同一个来自山东莱阳生物公司的客户洽谈。笔者随孙博士走进公司所在的中关村创业大厦办公室,看见一台设计精巧的自动化机器,他兴致勃勃地讲解这台主题为自动化蛋白晶体筛选成像系统的产品。

他介绍说,现代化的药物研发技术,离不开对药物靶标蛋白与其小分子抑制剂的三维结构研究,要分析蛋白质的高分辨晶体结构,则需要纯化后的蛋白质从溶液中结晶出可以进行X射线衍射的晶体,然后通过衍射数据解析出蛋白质(或加上其小分子抑制剂的复合物)结构,蛋白质形成晶体(晶体筛选)很多时候是一个漫长和痛苦等待的过程,少则需要数百个条件,多则可能成千上万个。这种自动化蛋白质晶体筛选成像分析系统,用于对海量筛选的蛋白晶体生长条件的检测,可以大大提高工作效率及数据记录的完整性及精确性,因为以前这方面的观察与记录完全是靠研究者手工进行的。我们的客户目前主要是各大专院校及研究机构中的生物化学、分子生物学,特别是从事结构生物学研究的实验室,药物研发机构与企业正在加入我们的用户行列,多家国外企业(包括一些国际知名公司)也在与我们洽谈中。

采访过程中,孙博士说,随着科学技术发展到目前的所谓后基因组学时代,生韧科学研究在规模和速度上都有了极大的飞跃,结构生物学也不例外。今天,结构生物学研究已经迈进了所谓结构基因组学时代,世界各国纷纷启动了结构基因组学计划,建立高通量、大规模的蛋白克隆、表达、纯化、结晶以及晶体结构解析平台,以开展高效、快速的蛋白质结构和功能研究工作。

国际上多数国家的结构基因组学研究中心的基因克隆、表达和纯化都倾向于使用相应的机器人或自动化仪器,这些机器人的出现和使用大大加快了基因克隆、表达和纯化的速度。例如,利用Beckman-coulter的机器人系统在一个月内可进行上千个基因的PCR反应、克隆连接反应、各种DNA纯化及阳性克隆的检测等等。这些自动化仪器的使用可以几十倍地提高蛋白质制备的效率。如果能够从这些纯化好的蛋白质中快速得到可衍射的单晶,收集到足够好的衍射数据,就可以大规模、高通量地解析其三维结构。如果我们能够解析出10万个具有代表性的蛋白质三维结构,人类就能够完全掌握及预测其他成百上千万的已知蛋白质结构,这正是国际上广泛开展的结构基因组学研究的宏伟目标。然而,由于蛋白晶体结构解析过程步骤多、耗时长,特别是进行结构基因组学研究所需的自动化大型仪器设备价格昂贵且难于掌握,需要训练多年的专业人才使用维护,解析一个蛋白质晶体结构的平均价格是很高的。

孙博士说,从理论上讲,只要找到合适的晶体生长条件,可溶性的蛋白质几乎都可以得到高质量、适合于结构解析的晶体,要想进行成百上千个晶体结构解析,尽快得到蛋白晶体是关键。以前的小作坊、手工操作式的蛋白晶体生长方法已经不适合现代化结构基因组学研究的要求,但是,国内外市场上适用于一般大学及研究所实验室的经济耐用的自动化设备几乎没有。基于这种情况,结合结构生物学实验室的具体需要,公司科研人员正在研发具有自主知识产权的蛋白晶体生长及观测系统,目前自动化图像记录系统部分已经初步完成,样机能够投入日常使用。样机测试结果显示,此系统可以提高工作效率十倍以上,并且在精度、准确性及实时监测方面具有手工操作无与伦比的优越性。发达国家类似产品售价是我们产品的3~4倍。估计目前国内的潜在用户为几十到上百家,国际用户则可能在千家以上。XtalQuest公司也在研发与自动化蛋白晶体生长相关的蛋白质结晶试剂盒系统和各种高效率、高通量结晶板及有关耗材,希望为蛋白晶体结构与功能研究相关用户提供全方位的服务。而对于蛋白质结构与功能研究有兴趣的实验室,在国内就有几百到上千家,并且还在快速增长中。

孙博士对博亚捷晶科技公司产品的市场前景相当乐观。随后,他谈起在瑞典和美国的学习、工作经历。

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