药师兜是日本漫画《火影忍者》及其衍生作品中的角色。药师兜擅长医疗忍术，幼年时被培训成忍者间谍搜集情报，之后加入音隐村成为大蛇丸的手下。在与佐助和鼬的战斗中陷入伊邪那美，最后重拾自我并前往战场治疗佐助。战后被允许在木叶开设孤儿院，回到自己最向往的生活。
“兜”的名字，是他在孤儿院时院长药师野乃宇起的名字；“药师”的姓氏则是继承了野乃宇的姓氏。
“药师”一词源自传说中的神祇药师如来。传说中的药师如来能为信徒消除烦恼，免其受苦，消灾延寿，灭除一切灾劫病苦。另外，照字面意思，药师的名字正显示了其对药物（兵粮丸、凝血丸）及医术的精湛掌握，所以在漫画中发现药师兜使用过各种药丸，以及高级的医疗忍术。
“兜”是一种日本古代武士的头盔。是兜初到孤儿院时，被院长随口起的名字。大蛇丸安插在木叶的间谍三人组——药师兜、赤胴铠和剑美澄，他们名字里的“兜”、“铠”、“剑”都是武士的装束，这些名字似乎表达了他们想要隐藏间谍的真面目这一点。
第三次忍者大战时期，兜在不知父母及名字的状况下被孤儿院院长药师野乃宇收留，幼年时期就天资聪颖，但由于视力不佳，刚好院长与自己度数相符，因此院长将自己的眼镜送给兜，且兜也学会了医疗忍术，但在一次帮助木叶忍者疗伤时初次遇见了还是木叶忍者的大蛇丸，因此被大蛇丸看了上眼。后来志村团藏连同大蛇丸和一名油女一族突然出现在孤儿院，要胁曾在谍报部有“行走的巫女”之称、旧名药师野乃宇的院长前去长期侦察岩忍者村是否有拟定大规模作战计划，团藏在查觉到在窗外偷听的兜后，声称需要孩童成为木叶忍者来替补获得这次情报牺牲的团藏部下，并以当次的补助金作为交换条件，成功将兜纳入自己麾下。从此，兜被培训成忍者间谍，在云、雾、砂、岩等其余国家的忍者村搜集情报，擅长伪装自己的行踪及气息。五年后在岩忍者村待命的兜因为失误遭遇袭击，与他交战重伤的敌方忍者竟然就是院长，试着呼叫她，但濒临死亡的院长不认得他，随后兜被其他支援的敌方忍者逼退，迷惘的兜独自一人到了河边思考着自己为何会被最重要的人给遗忘，这时遇见大蛇丸，被带至他的基地作为第一位访客，随后从大蛇丸口中得知团藏在他一离开孤儿院就向院长说出其实兜是为了他们的补助金而自我牺牲、加入了“根”，在院长的请求下团藏宣称只要杀死某个人就会解放兜，而那个要杀死的人实际上就是“真正的兜”，原来一开始团藏为了避免两人相遇把他们分配到不同地方执行任务，院长只能借由照片了解兜的成长过程和安全与否，而照片在中途被换成别人的照片，导致不知情的院长去杀害被她当成双重间谍又试图解救的兜本人，而大蛇丸原本是奉命要同时解决掉兜和院长，但是因为看上兜的才能而无意执行，在得知真相的兜决定接受大蛇丸邀请加入不隶属任何国家的音忍者村，并利用大蛇丸为他捏造的身份重返木叶。
大蛇丸加入晓以后，让兜假装跟随蝎。蝎以为兜被自己施了术以后，成了自己派去打入大蛇丸身边的间谍，但蝎没有想到的是，大蛇丸破解了他在兜身上施展的术，并反过来利用这一点刺探晓的情报。
三年期限已到，大蛇丸的容器面临极限，兜加紧为大蛇丸配制各种药物。却不知佐助就在大蛇丸处于虚弱时，破了其不尸转生之术，杀死大蛇丸并夺去其一切力量。当佐助从大蛇丸房间走出来的一刻，兜明白到经过他面前的已经不是大蛇丸，而是实力比大蛇丸更厉害的佐助。对从小当过不同国家的间谍、无所归依的兜来说，感觉再次失去人生目标及身份。然而他想起了鸣人既然能借由超越自身的力量、找到自己的真正身份，自己同样也可以做到。于是他便把大蛇丸剩下的躯壳移植到自己的左半身，意图得到大蛇丸的力量，甚至超越他。但他却不擅于操控从大蛇丸移植过来的躯壳，因此却反给大蛇丸慢慢侵蚀。此外他也私下跟正追踪佐助的鸣人、雏田和大和会面，把详细介绍“晓”成员的资料本送给鸣人，以作为鸣人令自己有所“领悟”、及重新寻找身分的“礼物”。鸣人他们欲逮捕兜回木叶，但兜却以替身术避开，并且表示只要他能熟练运用大蛇丸的力量，便会和鸣人认真一战。但他表示要先对付佐助，鸣人想问兜要对佐助做什么，但他却消失在众人面前。
四战时，之后的修炼中，兜完全掌控了与大蛇丸相同的力量，身躯似乎已经和蛇的形态产生融合，以至于外貌像大蛇丸。他在泷隐村杀人取尸体后和带土对峙时，自称已经超越二代火影和大蛇丸，将宇智波鼬、蝎、迪达拉、角都和长门秽土转生，并且以提供带土目前缺乏的战力来换取佐助交涉条件，对带土提议携手合作。带土本来因他以佐助为目标而想拒绝他。但兜在黑绝的帮助下找到了宇智波斑的尸体并秽土转生，最后带土被迫同意。交换条件是战争结果出炉前不能与佐助碰面，以及必须接受带土的监视。由于兜对转生者的束缚力不够，于是绑架前来侦查御手洗红豆，并吸收她身上咒印的大蛇丸查克拉以强化控制力。
其后，药师兜与宇智波佐助及用别天神摆脱秽土转生的宇智波鼬交战，兜在交战后被伊邪那美击败后，被宇智波鼬用幻术控制解除秽土转生，除了宇智波斑之外，所有被秽土转生的灵魂都已解除秽土转生，但是宇智波斑知道如何脱离秽土转生的控制，在秽土转生即将解除之际，终止了与转生者之间的通灵契约，才得以继续留在战场，随后以解邪法印重生的大蛇丸解除了兜的仙人模式，取回自己的查克拉后与鹰小队同行。
兜最终重拾自我，终于脱离了鼬的伊邪那美，以仙人模式出现在战场，在二代火影的帮助下，用医疗忍术抢救濒死的佐助，让佐助能够再战宇智波斑。
斑开启无限月读以后，兜连同其他人一起中了此术并被神树缠绕。
最终木叶原第七班结束了第四次忍界大战，无限月读被解除，包括兜在内的所有人终于重获自由。
由于兜已醒悟，并且曾在第四次忍界大战中抢救佐助，间接带来忍界大战的胜利，所以不用再被列入叛忍名单中。
兜与儿时的伙伴乌鲁西一同在木叶开设了孤儿院，并担任院长，重兴当年养母的旧业。
鸣人等人返回木叶后，将带回的一众克隆人“宇智波信”托付给了兜。
