云轩跟随墨痕来到最高统帅部。
在窗外，他看着墨痕的怒火倾泄在几位皇家近卫军将军的头上。
“这是我团队的研究！”墨痕近乎手舞足蹈地说：“我们辛苦研究几个月，终于得到结果。而你们却想白拿，我是不可能让你们得到的。再说了，你们有什么权利来干涉最高统帅部的决定。你们，你们只是一群打手罢了！研究资料我是不可能给你们的！”
显然几位将军都被震慑住了，其中一位手颤颤悠悠地拿出一份文件，说道：“皇帝亲自下令，让你把研究资料交给皇家近卫军。”
墨痕丝毫不慌张，打开电脑，对那位皇家近卫军将军说道：“那我现在销毁资料，谁也别想要。”说着便要按下销毁键。
见此情型，将军大声说：“你不要命了吗？如果你销毁资料，你也会死的！”墨痕：“那你们还在得不到资料！”墨痕在等待一个机会，一个谈判的机会。
几分钟后，将军认怂了。主动提出谈判。
半小时后，谈判结束。新型武器将率先装备帝国近卫军。但是资料也必须给皇家近卫军，同时皇家近卫军也可以拥有自己的生产线。
谈判结束后，墨痕尽管为自己争取到了最大的利益，但仍对皇家近卫军的无礼取闹感到愤怒与不平。不过迫于皇帝威压，他不得不交出资料。
回去后，墨痕闷闷不乐。而西罗斯却在这个不恰时宜的时间向墨痕发出一个秘密会议的邀请。
墨痕去时会议已经开始，但墨痕却发现了一个惊天秘密：最高统帅部许多高级将领都想推翻威廉皇室，这个已经延续了千年之久的王朝。
他们断定，威廉八世命不久矣。他一死，就是发动政变的最好时机。但最大的威胁是太子威廉皇子。他一是威廉八世钦定皇位继承人；二他在军政两界影响力颇为巨大，可以得到国防军部分将领的支持。除掉他的主要原因是因为他大力推行削弱国防军与近卫军势力，同时并不主张处刑队的消除外星土著的做法。
来自国防军的众将领都一致认为，必须刺杀太子。而此时墨痕却站起来说：“为什么一定要我们做？难道不能交给我们的敌人去做吗？”一位将领说：“如果将太子出行计划泄露给美利克里斯帝国的话，可是叛国罪！”墨痕：“如果他在旧金星上被刺杀就不关我们的事了。”
几位国防军将领露出了惊讶的表情，随后说道：“我们目前不可能占领那里。”墨痕：“你怎么知道不可能？”说着便展示了新型武器的二号原型：
在技术上与上次在最高统帅部展示的没什么区别。在基因上改进主体是地球生物这一缺点，基因主体之一为阿瑞斯虫族中的士兵虫种。阿瑞斯虫族，是已知虫族中最强大的虫族。基因主体还有一种是金盘中记录的，自然体早已灭绝的蜘蛛。它们本来就经过大量的基因融合，而且还弑杀成性。被认为是宇宙中最残暴的种族之一。
两者经过基因融合与修改，其修长且尖锐的腿，恐怖的叫声，浑身散发着暗黑紫与黑色的光茫……无不令人恐惧。当然，这次它也保留了一号原型的大部分副要作用。火力系统减少为四挺激光机枪。
墨痕：“它现在就可以投入量产，预计三个月后就可以装备全部近卫军。”
在报复皇室的驱动下，墨痕想出了一个更大怛的计划：进攻并征服美利克里斯帝国地球本土。
计划很简单，由于新型生物武器不需要调用太多军队来辅助，所以近卫军可以进行第二次闪电战。再加上美利克里斯帝国将大部分精力投入到殖民地战争中，地球布防稀缺。
在新型生物武器完成装备后，由帝国近卫军第4骷髅军团作为先锋，近卫军第7、8集团军700多万人与近卫军第6装甲集团军6000辆坦克。还有帝国近卫军死亡军团，也就是生物武器军团。
他们将在一周内突破美利克里斯帝国的边境防线并直逼美利克里斯首都旧金星。到那时，美利克里斯帝国必定会慌张不已地将所有精锐调回地球。帝国歼击舰会拖延他们的返回速度。包围并占领首都后，美利克里斯皇帝肯定会投降，毕竟他是一个贪生怕死之徒。届时，战争就会胜利。
经过五个月的准备，进攻开始。
第一天，美利克里斯帝国的防线被撕开了一个口子。防线后的多颗矮行星被占领。三天后，美利克里斯帝国水星驻军投降。第10天，在以盖尼米得交通线的夺取桥头堡的战役中，帝国近卫军死亡军团首次参加战斗并在巷战中疯狂屠戮。它的名气也随之大为传播，对美利克里斯帝国士兵的士气大为打击。
正当计划进行得一切顺利，神圣中意志帝国军队已经包围了旧金星，而殖民地的美利克里斯军队则乱成一锅粥，回援地球的远输船被歼击舰重创。同时他们也被死亡军团的传言吓得士气低迷，殖民地战线迅速溃败。
但就在这时，皇帝的一道旨令却泼了期望攻占旧金星后从而取得无限光景的墨痕一头冷水。旨令中写道：攻占旧金星的任务将交给皇家近卫军第1集团军完成。至于墨痕的军队，则被派往林克并攻占那里。
墨痕在得知这则消息后勃然大怒，这彻底激发出了他对皇室的仇恨。在交接的数周里，墨痕停止对美利克里斯运输线的打击，还开出数条漏洞，让美利克里斯援军源源不断地前来。为此，还取消了对旧金星的包围。据统计，有90个集团军进入旧金星，总计45000万人，加上皇室军队。一共有5亿人。还有6万辆坦克和所有能集合的空军力量。墨痕还提前6天离开，使美利克里斯军队成功夺回了第3、2条防线。
调回林克后，墨痕轻易地占领了那里。但他并没有对往日的回念，反倒是焦虑地等待着地球的情况。
在旧金星，美利克里斯帝国的抵抗异常强烈。皇家近卫军的90个集团军中太子的30个全部投入，三皇子投入了20个，在殖民地战线的二皇子也投入了15个。
经过五个月的巷战，太子的军队已经所剩无几，另外两个派去的也全部都损失殆尽。
正当经历惨痛损失，但仍为胜利感到高兴的太子在美利克里斯帝国广场举行由残部组成的阅兵时被美利克里斯帝国最忠诚的间谍之一刺杀。
这一事件引起了帝国内部的分裂：
首先，老皇帝威廉八世因此事勃然大怒，但他的身体却不允许他这样做，从而大病一场。一周后，宣告驾崩。
随即，人在地球的三皇子即位称帝，史称威廉九世。但在奥塔主星的二皇子明显不服，于是在手下的拥护中自立为帝，史称威廉十世。后又控制了克斯里昂要塞群和克赛拉基地。
作为正统的三皇子是不想看到二皇子的行为的，他给二皇子以谋反之罪名。想调用国防军和近卫军镇压，但却被最高统帅部拒绝了，他们说皇室纠纷那就让他们自己处理，谁赢了，谁就是正统。
于是两位皇子展开斗争。三皇子出其不意地占领了克赛拉基地，但在克斯里昂要塞群的进攻遭遇失败。刚经历了胜利的他志气高昂，亲自赶往克斯里昂要塞群。但原先快速打败对手的计划很快被打破了。速战速决成了消耗战，军队士气一落千丈。三个月后，三皇子的军队已经损失了90%以上；二皇子的军队也损失了80%左右。尽管双方都损失惨重，损失较轻的二皇子仍发起进攻并包围了三皇子。三皇子仓徨突围，逃出去的仅有几万人。
这时，近卫军骷髅军团和死亡军团在墨痕的指挥下占领奥塔主星并宣称要帮助正统皇帝威廉九世平定叛乱。
骷髅军团很快打退了要塞外围的二皇子军队，他们退守要塞群内。墨痕随即用破解金盘时所改进的反物质火炮轰炸克斯里昂要塞群，这效果比当年用古斯卫星炮还厉害，20座中19座被毁，1座重伤。这1座还是克斯里昂主要塞。随后墨痕让三皇子命令自己的残兵与克斯里昂主要塞内的二皇子军队展开巷战，美其名曰：让三皇子亲自面对胜利。其实就是让他的人当炮灰。本来他还想用他舅舅（威廉八世的第三个弟弟）反抗一下，但是他的舅舅因为企图收买国防军高官给他提供支援而被站在二皇子一边的另一个舅舅（威廉八世的第二个弟弟）给刺杀了这个消息很快传来。所以他只能命令他的军队进行巷战，尽管于心不忍，但也无奈地答应了。在前往前线指挥部的过程中，被一艘标有二皇子军队图案的骷髅军团歼击舰炸毁。
在接下来的两周里，皇室近卫军的成员在失去三皇子的指挥下仍完成了自己的誓言——战斗到了最后一人。
一周后，克斯里昂主要塞内的抵抗停止，二皇子被火炮击中身亡。这场皇室内战就此结束。
回到地球，最高统帅部已经除掉了支持二皇子的旧近卫军总指挥，任命墨痕为新近卫军总指挥。
随后，墨痕在西罗斯清洗了二皇子家族和威廉八世时期的旧贵族，还流放了太子家族剩余成员。同时又软禁三皇子家族成员，拥立了三皇子一位年幼的侄子作为傀儡皇帝：威廉十一。
在之后的三个月里，墨痕先是以皇室内战时现任首相曾支持过二皇子为由赶他下台，然后让威廉十一任命自己为首相。
墨痕担任首相后，先是任命西罗斯为处刑队总指挥，然后发动了“大清洗”，对国防军与近卫军内部仍忠于皇室或反对派进行清除。这场“清洗”整整持续了三个月，到结束时，反对墨痕的声音几乎已经消失。另一边，墨痕与贵族谈判，确定消灭皇室后不会危害贵族利益，当然，这是在贵族不反对的前提下。贵族各集团答应了。
同时，墨痕还与各商业，金融巨头表示将保护他们的权利，并给予他们对前美利克里斯帝国领土投资权。
这一切是建立在消灭前美利克里斯资本的前提上，当然，所有人除了那些资本外都同意了。
另一方面，消灭前美利克里斯资本后，通过更严重剥削殖民地的方式，恢复了前美利克里斯地区的经济。现在，美利克里斯帝国不仅仅从军事上，更是从经济上，已经彻底土崩瓦解了。
得到这些胜利的墨痕于8033年1月30日率领军队在皇帝宫殿举行武装起义并成功使威廉十一退位。
当天，他做了三个决定：
一，自封为帝国元首，统领一切军政事任。
二，废除长久以来的首相制，加强元首权力。
三，处死所有皇室成员。
之后几天，皇室力量被摧毁，而墨痕在军队，贵族，金融巨头们的支持中正式成为元首。
2月10日，墨痕通过“合并法案”，将所有中意志帝国的仆从国吞并。后又解散星际联盟，完成了真正意义上的人类统一。
2月20日，神圣中意志帝国更名为“人类神圣中意志第二帝国”。
之后，近卫军独立于最高统帅部，被元首亲自指挥，近卫军副总指挥为云轩。处刑队总指挥仍是西罗斯并接管了所有殖民地的管理权。
2月23日，帝国通过“种族法案”，全面禁止了人类与其它外星类人类智慧生物混血，取消混血儿的繁殖权利。
到了3月初，大部分变动已经结束，帝国新的国策已经定好。即一致对外扩张，剥削殖民地来供给地球本土所需的资源，消灭一切外星文明，光速提高文明等级，应对战争。
至此，人类已经统一，帝国也已改朝换代，而战争的阴云也慢慢地降临在地球的上空。
