心之怪盗团的众人所进入的这个“柊爱丽丝的牢狱”，严格说来并不是真正的牢狱，毕竟将牢狱创造出来的EMMA已经消失了。这个地方是位于混乱时空中的一个特异的异空间，简单理解的话就是“对过去的模仿再现”。
或许是因为当年奥梅堤奥托在扭曲现实的时候做了什么手脚，使得雨宫莲等人在影时间里的相对应地点、找不到索菲亚的身影。于是，借由着救助结城理时的经验，雨宫莲才想到了借用圣杯碎片的力量。
而在这个早已被圣杯扭曲的世界里，同样也可以利用圣杯的力量开辟出他们内心所期望的道路——于是有索菲亚存在的柊爱丽丝的牢狱就这么被再现出来了。
雨宫莲等人一边清扫着这个位于另一个次元的地下水道里密布的阴影，一边开始了地毯式的仔细寻找。最终，他们在一个又脏又乱的垃圾场一样的地方，找到了他们这次要找的目标之物。
只见出现在众人眼前的，是一个比常人还高半个身的黑色正方体异物，漆黑的表面印刻着灰白色的纹案、如同电子元件上的回路一样复杂。
初次见到这个的芳泽堇、布雷迪、长谷川善吉和丸喜拓人都露出一脸惊叹的神情，有种不明觉厉的感觉；
唯有第二次见到这个令他熟悉之物的雨宫莲松了一口气，原本一直担心而紧绷着的表情也露出了一丝笑容，喃喃道：“太好了，果然你还留在这里啊，索菲亚……”
名为“索菲亚”的怪盗团同伴，是雨宫莲和他的伙伴们在六年前的暑假被卷入某个事件时，在位于涉谷的异世界牢狱中相识的，之后为了帮助他们解决各地频发的改心事件而加入了怪盗团，行动代号是“Sophie（索菲）”。
索菲亚并不是人类，而是由仙台东凰大学所属的一位天才级的人工智能研究者——一之赖久音在最初时为了理解人心才开发出来的人工智能。然而因为刚诞生时还等于是一片空白的她，没有达成制造者一之濑久音的内心期望、反而还触及其心伤，所以遭到了遗弃。
遗弃的地点，当然是一之濑久音的老家所在地涩谷——这也是雨宫莲二话不说的直接带人往涩谷跑的原因。
在这个被扭曲的世界里，实际发生过的EMMA相关的一系列事件被当做没有发生，EMMA这个曾在六年前风靡一时的人工智能从所有人的记忆中消失了。当然，“从记忆中消失”并不代表“实际消失”，所以EMMA暂且不论，作为EMMA原型的索菲亚依旧存在。
只不过现在看来，索菲亚的状态自动退回到了被怪盗团发现之前，所以才会一直沉睡在这个位于涩谷牢狱的地下水道之中。
“原来当初你们就是在这里发现索菲亚的啊。”长谷川善吉作为索菲亚的旧识，对于索菲亚的再会更有感触。
“那么接下来应该怎么做？”他扭头问向自家的首领。
雨宫莲毫不犹豫地答道：“当然是唤醒她。”
他一边说着，一边走上前，伸出的手触碰到正方体之后，就如同触发了某种感应程序而起了反应。随即便见电子回路的纹样上散发出阵阵白光，并从巨型的正方体上分裂出无数的小方块、同时不断朝里进行压缩，整体逐渐变化作另一番形态。
最后在一阵刺目的白光之中，在场众人的脑海里莫名地涌进了一句话：
『你希望我成为什么？』
光芒散去，原本的巨型正方体已经消失不见，取而代之的是一名双马尾发型的红发少女。
“嘿~她就是你们所说的人工智能啊，是比我想象中的更接近人类的姿态呢……”作为学者的丸喜拓人，对于同业不同行的另一名学者制造出的AI很感兴趣的模样。
“喔喔，是一个长得很可爱的孩子呢。”布雷迪优先从下往上看。
芳泽堇的关注点则是有些歪了：“太好了，终于有一个女孩子加入，我不再是一个人了。”
雨宫莲没有理会身后伙伴们的讨论，而是有些紧张地盯着眼前的索菲亚。长谷川善吉也同样无言地观察着索菲亚的表情，因为他抱有和雨宫莲一样的担心。
索菲亚睁着好奇的眼神，又带着些疑惑的神色打量周围，喃喃道：“这里是哪里？”
之后她将目光放在了面前的雨宫莲身上，歪歪头问道：“你是谁？”
雨宫莲眼神一黯，微微一叹：“果然如此吗……”
他早就预想到了这种情况：因为与索菲亚的相遇被从记忆中抹除了，所以索菲亚还保持着原来的样子、一直停留在这里牢狱的地下水道里。虽然他们成为伙伴相知相遇的事情真实发生过，但对于如今的这个记忆被消除的索菲亚来说，这才是他们第一次见面。
看到雨宫莲露出困惑的表情，索菲亚微笑着说道：“初次见面，我的名字是‘索菲亚’。请问你是遇到困难了吗？有困难的话我可以帮忙喔！我是人类的好朋友，是为了帮上人类的忙而诞生的！”
雨宫莲的脸色有些古怪，开玩笑地问道：“那么能请你回忆起与我们有关的记忆吗？”
索菲亚当即一脸问号：“记忆？我们不是初次见面吗？”
这时候，丸喜拓人笑着站了出来：“嘛，接下来就交给我吧。”
雨宫莲看向了丸喜拓人，并朝对方点头示意。
“索菲亚小妹妹，你放心，我们都是你的伙伴，而我现在只是打算给你‘治疗’罢了。”丸喜拓人一边说着，他一边召唤出了亚当·卡蒙。
“治疗？”索菲亚感到很疑惑，“可我现在很好。”
“不，你其实并不好，只是你没有察觉到罢了。”丸喜拓人摇了摇头，又说，“你的认知和记忆都被扭曲了，而这种力量与我的‘曲解’能力有着极大的相似之处……想来这也是为什么我会被黑手盯上、而差点被杀死的缘故吧。”
“扭曲+曲解……”他说着嘴角勾起了得意的弧度，“即是等于——负负得正！”
