一座古庙起火，里面一幅700年前的神秘古画是唯一幸存者，而这幅画的背面有时光飞船上相同的符号。
神秘特工队来到画展中心找到这幅画的展览现场，惠子和玲子成功进入现场。杰森和何岩侦察清楚周围的情况，突然间发现昊天也在现场，何岩为了不暴露身份，找到昊天，希望他能保守秘密，昊天答应了他。惠子和玲子来到储藏室找画，没想到地下室里面布满了细细的纵横交错的红线。由于已经被敌人发现，惠子大摇大摆地走了进去，触动了报警装置，但是画根本不在储藏室，柯林查到画已经被昊天带走了。
昊天给赵军忆上校打电话，告诉他画已经到手，但是神秘特工队出现了。没有拿到画的惠子和玲子准备离开，昊天出现，希望何岩等人能够和他合作解出时光飞船上符号的意义，何岩答应。
柯林和杰森正在说话，惠子鼓励何岩去和她们说话。玲子打算去偷画，看到了昊天，已经被洗脑的昊天打晕了玲子，而昊天正是黎影假扮的。黎影的同伴假扮昊天去抓何岩。
何岩将自己藏在车库，不愿意和别人交流，惠子劝他。假扮的昊天来到神秘特工队，直接叫走柯林和黎影谈判，假扮的昊天在神秘特工队队员周围里装上了病毒炸弹。
何岩和假扮的昊天在车上谈话，何岩怀疑假扮的昊天。何岩意识到
玲子醒过来，暗夜希望将她洗脑。玲子趁机挣脱，将暗夜打到。而何岩识破了假的昊天，两人动手。昊天赶来帮忙，真假两昊天打架，而何岩则去找画。昊天成功打败暗夜死士，而何岩击倒死士，将画拿走。
病毒炸弹启动，何岩意识到问题的所在，赶紧和柯林一起将炸弹拆除，神秘特工队的飞机安全。
惠子找到玲子，两人撤离。昊天要和何岩庆祝今天俩人的成功合作，而何岩也卸下心结，和大家打成一片。此时汪琦回来了，想要和岩和昊天将今晚的情况讨论一遍，昊天希望能够和汪琦面谈，汪琦拒绝。汪琦意识有人和他一样也想知道方时光飞船上的符号，将之刻在了那幅画的背面。而杰森的真实身份是暗夜的卧底也渐渐浮出水面。
原来柯林已经给杰森准备好了后路，如果杰森不能够待在神秘特工队，柯林就会将杰森送去她父亲身边。杰森对这样的安排十分感动，但是汪琦命令柯林现在就杀了杰森。
