唐太宗在洛阳宫初次接见玄奘，即为玄奘堂堂的仪表、豁达的风度、睿智的谈吐、渊博的学识所倾倒。他特别注意到向玄奘询问西域的情况时，玄奘都能有条不紊地一一作答，唐太宗兴奋地对大臣们说：“过去前秦符坚称道安和尚为神器，举朝尊崇。朕今观法师，词论典雅，节操高尚，风节贞峻，非惟不愧古人，亦乃出之更远。”而且他认为玄奘有辅国佐政的才能，故劝玄奘还俗，助理国务。玄奘婉谢道：“玄奘自幼出家，学习佛教内典，而不闻治国的礼教，今让我还俗，就如让水中之舟，离开水域，而就陆地一般，不但使其无用，而且使之徒然腐败罢了。”唐太宗遂安置玄奘到长安弘福寺翻译佛经。
贞观二十二年（648年）唐太宗到远离京师，有林泉山壑之美的宜君别宫——玉华宫避暑。他敕令玄奘也到玉华宫，在他政务之暇，相陪清谈。唐太宗对玄奘十分尊重，他曾赐给玄奘衲袈裟一件，制作极其精美。这件袈裟是后宫之人用数年的功夫，才作成的。据说在贞观十一年，唐太宗到洛阳宫。当时名声很大的苏州道恭、常州慧定，两位高僧被帝召见。二僧各披一衲，据说是当年梁武帝赐给他们师父的，其师又传给他们，故非常珍视，特意穿了来见皇帝。唐太宗笑其制作不精，并命取出宫人制作的这件袈裟让二僧看。二僧见其精美绝伦，都想得到它，但唐太宗却赐给他们每人五十匹绢。这件袈裟留存至今，才赐给了玄奘。
在玉华宫唐太宗与玄奘朝夕相处，聆听玄奘谈论深奥的佛教哲理，而不觉疲倦。唐太宗深深佩服玄奘学识精博，而再次向玄奘提出，国家大事十分繁重，不是帝王一人能担当得了的，必须有贤哲的群臣辅佐才行，故希望法师能脱僧还俗，参与国政。玄奘回答说：“陛下是英武圣明的皇帝，有平祸乱、安国家、措刑政、定边陲的文治武功。现在左右也不乏像伊尹、姜尚那样的贤哲，玄奘愚陋，怎能胜任政务，恳请陛下不要勉强我放弃守戒佛门，弘扬佛法的夙望。”唐太宗遂答应不夺其志。
唐太宗晚年崇信佛教，十分喜欢听玄奘谈玄讲经，以至不愿其暂离身边。唐太宗自玉华宫还京后，令在紫微殿西侧，建造一座弘法院，让玄奘居住。白天陪帝谈论，晚上还院翻经。贞观二十三年（649年）四月，唐太宗到终南山别宫——翠微宫，令皇太子李治和玄奘陪驾前往。同年五月唐太宗逝世于翠微宫的含风殿。所以直至唐太宗去世时，玄奘都是陪侍在其身边的，可见唐太宗对玄奘的器重宠信。
