哈巴湖国家级自然保护区位于宁夏回族自治区盐池县中北部，属湿地生态系统类型自然保护区。保护区总面积8.4万平方米。2006年2月经国务院批准为国家级自然保护区。2009年哈巴湖生态旅游区被评为国家3A级旅游景区。
主要保护对象是荒漠—湿地典型的自然生态系统。保护区内有野生维管植物315种，分属于54科169属，其中有国家重点保护植物中麻黄、甘草、沙冬青、沙棘、沙芦草等6种。中草药资源极为丰富，是驰名中外的“甘草之乡”。保护区内有国家一级保护动物白尾海雕、大鸨、小鸨、黑鹳等4种；国家二级保护动物荒漠猫、兔狲、鹅喉羚、大天鹅、白琵鹭、蓑羽鹤等18种；宁夏回族自治区保护动物28种；濒危野生动植物种国际贸易公约规定保护动物28种；中澳保护候鸟及其栖息环境协定保护的鸟类43种；中日保护候鸟及其栖息环境协定规定的保护鸟类8种；国家保护的有益的或者有重要经济、科学研究价值的陆生野生动物65种。保护区和北京林业大学联合开展了植被封育和沙漠化监测与评价研究项目，通过开展系统的监测和研究，探索和揭示湿地—荒漠化变迁的一般过程，过渡地带荒漠草原植被的变迁规律，人类经营活动对湿地、过渡地带植被的变化和影响；探索合理开发利用方式，提高该地区自然资源有效利用方式及经营管理能力，为荒漠化土地综合治理、改善生态环境、恢复植被景观提供科学依据。
保护区动物区系属古北界的东北亚界东北区的黄土高原亚区和中亚界的蒙新区西部荒漠亚区。同青藏区的青藏南亚区和东洋界中印亚界的华中区西部山地高原亚区相接壤。有脊椎动物25目50科140种和44个亚种，其中鱼类2目3科10种、两栖类1目2科2种、爬行类1目3科6种、鸟类14目29科90种、哺乳类6目13科32种。如此独特的自然条件拥有如此丰富的动植物资源在同类地区实属罕见，被誉为“西部种质和遗传资源的基因库”。
2002年经国家林业局批准在保护区实验区内建立花马寺国家森林公园。森林公园内山、沙、水交融，树木繁茂，沙山雄浑，草原广袤，沙滩浴场细软宽阔，湖水清澈湛蓝，风光旖旎，景色壮美。有“花马鸟瞰”“沙海观云”“云中折柳”“西湖烟云”“柳浪听莺”“沙岛观潮”等知名景点，同时又有悠远漫长的哈巴湖细石器文化遗址、历尽沧桑的古城堡、闻名遐迩的隋明长城和香火旺盛的花马寺等历史遗迹，是人们旅游观光、科考探险、消夏避暑的理想之地。
