此时的司马攸不知道，他满怀期待的伐吴大业，又出现了一次意外。
中原爆发旱灾，荀勖赈灾不力。百姓饥饿，纷纷食用野味，野菜，后来开始吃老鼠，导致大规模瘟疫爆发。他和孙瑛一路进入洛阳境内，时常看到百姓饿死于路旁。
二人骑马一路走向洛阳城，“这么多老百姓饿死，发瘟疫而死于路旁，官府却无人问津。如果晋国皇帝这样治理天下，比孙皓又好得了多少？”孙瑛埋怨道。
司马攸回道：“京城中一定发生了什么事情。皇上正在积极厉兵秣马，如果爆发灾情，不会坐视不管的。”他取出两块白布，对孙瑛说道：“我听父亲说过，建安年间爆发过瘟疫，瘟疫可以通过病人近距离的气息和飞沫传播。我们捂住口鼻。”
二人将口鼻捂住，飞马奔向洛阳城。此时的洛阳城中，家家闭户，昔日繁华热闹的街道变得冷清起来。
百官听说齐王回来了，纷纷前往齐王府觐见。
张华对司马攸说道：“齐王啊，你是不知，你离开的这段时间，由于旱灾爆发，荀勖治灾不力，结果瘟疫又爆发了。如今太后和皇上都感染了，现在的京城是人心惶惶，你滞留在吴国的事也就没人去留意了。”
“皇上和太后都感染了？不行，我得去看望他们。”司马攸着急了。
“现在去看望皇上和王太后，只会让自己也被感染。现在百官们听说你回来了，都急着来见你。甚至有些官员私下议论，如若皇上有失，拥立齐王登基。明眼人都知道，大晋如今的情况，如果痴呆的太子登基，是不可能好转的，甚至会更加糟糕。”张华忧虑道。
“如果皇上听到这个风声，岂不是要猜忌于我？我现在对皇位无意，只求尽快统一天下，还百姓一个太平盛世。”司马攸解释道。
忽然齐王府外一片嘈杂之声，一群大臣不顾侍卫阻拦，拼命挤进来。“我们要见齐王！”“齐王！”大臣们情绪激动地喊着。
司马攸走出府邸，大臣们见状纷纷下跪，领头的是尚书令卫瓘。卫瓘朝司马攸磕头不止：“齐王啊，救救这大晋社稷吧！如今皇上和太后都染上了瘟疫，命悬一线，无人理政。本来按照律法，皇上不能理政时，由太子监国。可是太子年幼愚钝，不堪重任。老臣恳请齐王监国啊！”
司马攸谦虚道：“孤何德何能，得百官拥戴。可是孤无意监国，不堪担此大任。请各位从宗室中再寻一能人监国吧。”
卫瓘大哭道：“齐王啊，宗室中，只有你是皇上的亲弟弟，你是皇上最亲近的人。军功又在诸王之首。如果齐王不监国，这场瘟疫带给大晋的，将是亡国之祸呀！”
张华对司马攸说道：“齐王，社稷和百姓才最重要。先把这场瘟疫解决吧。”
司马攸沉吟片刻，答应群臣道：“孤答应你们，一定不辱使命，积极治理瘟疫，与诸位共渡难关！”
齐王司马攸担任监国后，积极治理瘟疫灾情。颁布命令：“在灾区设立隔离区，不许随便出入。所有百姓房屋开窗通风，碗筷毛巾用沸水每日消毒一次。外出需用布条捂住口鼻，不去人群密集的地方。禁止捕猎。减免赋税，在灾区开设粥棚，提供百姓饭食。病死的人和牲畜，尸体必须火化后方可下葬。所有灾区的药堂，黄连、苦参、连翘、大黄、生地、知母6味药材，由当地官府统一出资收购，分发给灾民。”
不几月，疫情得到明显控制。齐王司马攸耗尽了国库用于南征的经费，将瘟疫控制住，减少了百姓的财产损失。一时，百姓人心大悦，齐王的名望传遍中原大地。
