张之洞去世后不久，被贬居彰德的袁世凯大有卷土重来之势。辜鸿铭在许多公开场合辱骂袁世凯是“贱种”，是“流氓”，他还在《张文襄幕府纪闻》一书中嘲笑袁世凯的智商只相当于北京街头刷马桶的老妈子，袁世凯耳目众多，难保他不清楚这本坏账。外务部尚书梁敦彦是辜鸿铭的顶头上司和多年好友，他为辜的安全担忧，恐怕他难逃厄运，便及时向辜鸿铭发出警报，要他赶紧逃生。辜鸿铭够倔，但并不傻，他立刻辞职南下，跑到上海，出任南洋公学的校长（也有记载称他做的是教务长）。
1911年冬，唐绍仪、张謇在上海为袁世凯罗致人才，想把辜鸿铭招至麾下，他们知道辜鸿铭是忠心耿耿的保皇党，清廷却并未厚遇过他，于是设宴于名店，引用孟子的话去打动他，“君之视臣如犬马，则臣视君如国人；君之视臣如土芥，则臣视君如寇仇”。瞧，这话说的，就像是倒提宝剑，授人以柄，辜鸿铭当然不会错过冷嘲热讽的机会，他说：“鄙人命不犹人，诚当见弃。然则汝两人者，一为土芥尚书，一为犬马状元乎？”这话的意思是：“我的命不像别人那么好，理应被遗弃。然而你们两人，一个是清朝的邮传部尚书，一个是光绪二十年的恩科殿试状元，地位和功名不可谓不显著，岂是寻常的土芥和犬马可比？”辜鸿铭讥刺唐绍仪和张謇热中功名，忘恩负义，他掷下杯子，拂袖而去。辜鸿铭的话算是挖苦到家了，唐、张二人自取其辱，好生无趣。
1916年，袁世凯的皇帝迷梦被蔡锷的远射踢爆，退位后不久，一命呜呼。他活着时，老百姓难获生人之趣，他死了，北京城仍要禁戏三天，娱乐场所悉数关门歇业。辜鸿铭不理会这道官方禁令，他将戏班子接至家中，照旧开演。警察登门干涉，他白眼告知：袁某某是忌日，我可是生日，这戏不演不行。警察也知道辜疯子的厉害，跟他不可较真，于是睁一只眼闭一只眼，听之任之。
1917年，蔡元培主掌北大，以“兼容并包”为办学宗旨，延聘辜鸿铭为北大英文门教授。蔡元培的理由是：“我请辜鸿铭，则因为他是一位学者、智者和贤者，而绝不是一个物议飞腾的怪物，更不是政治上极端保守的顽固派。”
据翻译家李季在自传《我的生平》中揭秘，辜鸿铭到北大任教，实有一个小波折。1916年，李季所在的英文班专任英文教师是C先生，这位登徒子学问不弱，但常以妓院为家，就没好好地教过书，英文班的同学深致不满，强烈要求刚接掌北大的蔡元培校长辞退C先生，改聘辜鸿铭来给他们上英文课。为达成这一愿望，他们罢课数星期。李季笔歌墨舞地写道：“自C去而辫子先生来，我们不啻‘拨开云雾见青天’。”名师出高徒，李季用文言文翻译辜鸿铭的英文社论，就恰成双璧，得到了“辫子先生”的首肯，传为佳话。辜鸿铭是天字第一号的保皇党，他时刻以前清部郎自居，脑后拖着灰白小辫，在北大激昂亢进的氛围中来去招摇，保持鲜明的个人姿态。他反对女生上英文课，反对新文化运动，确实是当年一道奇异的景观。“辫帅”张勋复辟时，辜鸿铭在外交方面竭尽绵薄之力，梁敦彦荐他做外务部侍郎，据说张勋期期以为不可，理由是“辜鸿铭太新了”，这真是令人啼笑皆非的笑谈。好在那幕复辟闹剧只折腾了十多天就草草收场了，倘若再闹下去，保不定还会闹出更多更大的笑话。
辜鸿铭对其日本籍夫人吉田贞子珍爱有加，由于爱屋及乌，他特别欣赏近代日本的政教和文化，他曾说：“有人纳闷处于孤岛之上的日本怎么会崛起为东方的强国。其主要原因就在于日本生下了许多我妻子那般贤淑的女子——她们像崇高的古罗马母亲一样伟大。”1924年，他应日本“大东文化协会”之邀，去东瀛巡回讲学（主题是“东方文化”），待了几年，并不如意。“东北大王”张作霖一度想聘请辜鸿铭为政治顾问，两人见了面，晤谈过几回，张作霖觉得货不对版，辜鸿铭也对张作霖观感不佳。他跟日本朋友萨摩维次谈及那次东北之行，仅仅一语带过：“张作霖只不过是个马贼，他哪里懂得政治与文明。”
1928年，军阀张宗昌欲委任辜鸿铭为山东大学校长，辜氏未置可否，即于4月30日下午逝世于北京寓所中，享年七十二岁。辜鸿铭曾对近邻和好友凌福彭（现代女作家凌叔华的父亲）说：他想刻一枚图章，同康有为的“周游三十六国”比一比，看谁的棒！他要印上自己的履历——“生在南洋，学在西洋，婚在东洋，仕在北洋”。辜鸿铭年轻时在武昌娶日本少女吉田贞子为妻（一说为妾），勉强算得上婚在东洋。可见他童心未泯，骨子里是好胜的，他不肯让康有为专善独美。还有一事也可见出辜鸿铭的好强，他自夸能够背诵弥尔顿的代表作、数千行的长诗《失乐园》，好友梁崧生抵死不肯相信，他就当场表演，拿出一本英文原著，请凌叔华的堂兄作证，把《失乐园》背得流水滔滔，原原本本，一字不错，硬是堵住了梁崧生的嘴，使对方不服气不行。
在北大当教授，辜鸿铭并没有把本分之中的传道授业解惑当回事，他第一堂课要学生将讲义翻到page one（第一页），等到最后一堂课他还是要学生将讲义翻到page one。授课时间全在嬉笑怒骂中过去，但他的嬉笑怒骂全是学问。辜氏的课上座率极高，并不逊色于胡适。社会活动家袁振英（1894-1979）在1915年至1918年间是辜鸿铭的受业弟子，他写过《记辜鸿铭先生》等多篇回忆文章，辜氏的顽固态度他并不恭维，但辜氏热爱中国文化，对外传播的超凡功力无人能及，高深的外文修养也足以俯视一世，袁振英极表佩服，他还特别认可辜氏诙谐有趣的教学方法，“学生也很喜欢”，“乐而忘倦”，辜氏“也很得学生爱戴，胡适之先生也比不上。因为北大在五四运动以前，还有许多学生反对新思潮的”。以怪论耸人听闻，以嘲骂语惊四座，以诡辩独擅胜场，眼瞧着那些青年听众两眼放光，舌挢[jiǎo，翘起]不下，被牵着鼻子走，这才是辜鸿铭乐此不疲的赏心快事。又有谁比北大的学生更合适做他的听众？要领会他的幽默讽刺，必须有点悟性。胡适初至北大任教时，辜鸿铭根本没把这位二十七岁的留美博士放在眼里，他批评胡适讲的是美国中下层的英语，与高雅不沾边，胡适“以为中国简直没有文明可言”的虚无论调，也令老爷子大光其火。胡适开哲学课，更让辜鸿铭笑掉大牙，他指出，欧洲古代哲学以希腊为主，近代哲学以德国为主，胡适不会拉丁文，又不懂德文，教哲学岂不是骗小孩子。
1915年9月初，代理校长胡仁源致完简短的开幕词，余下的时间就被辜鸿铭牢牢地攫在手中，尽兴地谩骂当时的政府和社会上的新生事物。他说，现在做官的人，都是为了保持他们的饭碗。他们的饭碗可跟咱们的饭碗不一样，他们的饭碗很大，里边可以装汽车，装洋房，装姨太太。又说，现在的作者文章都不通，他们所用的名词就站不住脚，譬如“改良”一词吧，以前的人都说“从良”，没有说“改良”的，你既然是“良”了，还改个什么劲？莫非要改“良”为“娼”？他这样讲了一个多钟头，许多人尽管不同意他的观点，但听得津津有味，盖因辜鸿铭的胡言乱语极为诙谐。
有一次，他向学生表示，他百分之百拥护君主制度，中国社会大乱，时局不宁，主要原因是没有君主。他举出一个小小的例子，以证明此言不虚：比如讲法律吧，你要讲“法律”（说时小声），没有人害怕；你要讲“王法”（大声，一拍桌子），大家就害怕了，少了那个“王”字就绝对不行。说到王法，还有一个笑话，辜鸿铭讨了一位中国太太，还讨了一位日本姨太太，她们对他很好，但有时也会联手对付这位古怪老头，因此辜鸿铭多少有点惧内，别人抓住这个题材调侃他时，他的回答出乎意料：“不怕老婆，还有王法么？”
